净化工作台可以根据气流的方向，划分为垂直工作台和水平流工作台，垂直流工作台能够在顶部，噪音较大的情况下，垂直净化工作台运用在医药工程中，垂直流能够保护身体健康，水平流噪音较好，风向向外，多用在电子行业中。
水平层的净化工作台，是一种通用性超强的洁净工作台，被广泛的用在精密仪器，电子，G防，制药行业以及仪表等。
垂直层流净化工作台，垂直单向净化工作台被广泛的用在局部洁净区域，生物制药，实验室，微电子，光电产业以及硬盘制造等*域。
洁净工作台水平送风，以及垂直送风都能够满足不同的实验要求。需要考虑的是气流型，一般使用垂直型，垂直型送风也就是垂直向下送风，准闭台式台面能够有效的防止渗漏以及操作异味对人体的刺激。如果将工作台放在显微镜下，垂直送风的气流阻挡，这种情况可以选择水平风，不过一般实验使用垂直型，玻璃门上下移动，总体来讲，水平和垂直风不存在着任何优劣之分，根据不同的实验要求选择合适类型。超净工作台对设备的清洁工作要求很严格，清洁包含例行清洁和定期熏蒸清洁处理，能够及时将缝隙内的赃物清理干净。清洁包含使用前后例行清洁，进行熏蒸之时，要对净化工作台完全密封，比如操作口的可移动挡板，能够更好的利用。
